Mặc dù diện tích nuôi giảm chút ít nhưng sản lượng tăng 7,4% so với năm 2010, ước đạt 2,93 triệu tấn, trong đó cá đạt 2,26 triệu tấn, tăng 7,5%; tôm 482.200 tấn, tăng 7,2%.
Giá cá tra vẫn biến động nhiều, đặc biệt đợt giảm giá đột ngột vào tháng 5, tháng 6 gây tâm lý hoang mang cho người nuôi. Để tránh rủi ro về nguồn cung nguyên liệu, các DN chế biến cố gắng tự xây dựng vùng nuôi hoặc phát triển các hình thức liên kết với người nuôi. Tổng diện tích nuôi cá tra theo các hình thức trong cả nước ước đạt 12.900 ha, giảm 2,2% so với năm trước, tuy nhiên sản lượng ước đạt 1,12 triệu tấn, tăng 9,3% so với năm trước.
Mô hình nuôi tôm sú theo hướng thân thiện với môi trường tiếp tục phát triển tại các địa phương, sản lượng thu hoạch ổn định và tăng khá, trong đó Cà Mau đạt 106.000 tấn, tăng 10,3% so với năm trước; Kiên Giang 26.000 tấn, tăng 10%; Tiền Giang 11.000 tấn, tăng 16%. Ngược lại, tôm sú nuôi công nghiệp bị bệnh nhiều do cơ sở hạ tầng chưa được đầu tư đúng mức và đầy đủ. Sản lượng tôm sú năm 2011 giảm 3,7% so với năm 2010. Tuy nhiên, sản lượng các loại tôm khác tăng nhanh nên sản lượng tôm nói chung không bị ảnh hưởng nhiều, trong đó tôm chân trắng đạt 139.400 tấn, tăng 34,5% so với năm trước.